- Aangeboren Afwijkingen van de Oesophagus
- Aangeboren Vaatafwijkingen
- Amsterdam Expertisecentrum voor Schisis, Craniofaciale en Luchtwegaandoeningen
- Amsterdam UMC Expertisecentrum Ontwikkelingsstoornissen
- Amsterdam UMC Multidisciplinair Lymeziekte Centrum (AMLC)
- Bot- en Weke Delen Sarcomen
- Centrum voor aangeboren Hartafwijkingen Amsterdam Leiden
- Cystic Fibrosis en Primaire Ciliaire Dyskinesie
- Endocriene en Neuro-endocriene Tumoren (ACcENT)
- Erfelijke kanker
- Erfelijke oogziekten en centrale sereuze chorioretinopathie
- Foetale Akinesie Deformatie Sequentie en Arthrogryposis Multiplex Congenita
- Gastro-Enterologische Aandoeningen
- Genetic Obesity
- Gynaecologische Oncologie (CGOA)
- Hematologische maligniteiten
- Hersentumoren
- Hoge Urinewegtumoren
- Hoofd-halstumoren
- Immuungemedieerde en Genetische Cholestase-syndromen
- Interstitiële Longziekten
- Leukodystrofiecentrum
- Marfan-syndroom en aanverwante aandoeningen
- Metabole ziekten
- Osteogenesis Imperfecta
- Primaire Immuundeficiënties en Beenmergfalen
- Pulmonale Hypertensie Expertisecentrum
- Retinoblastoom
- Spierziektencentrum
- Spina Bifida en Ruggenmergaandoeningen (kind)
- Systemische Auto-immuunziekten
- Vasculitis
- Zeldzame Bewegingsstoornissen
- Zeldzame bloedstollingsstoornissen en Rode Bloedcel Afwijkingen
- Zeldzame Botziekten
- Zeldzame endocriene aandoeningen
- Zeldzame Gastro-Intestinale Tumoren
- Zeldzame Hartaandoeningen
- Zeldzame pediatrische aandoeningen van nieren en urinewegen
- Zeldzame reumatologische aandoeningen bij kinderen
