Het Microbiologie Informatica Laboratorium (MIT) is verantwoordelijk voor het bouwen en onderhouden van een state-of-the-art data-analyse-infrastructuur ter ondersteuning van de operationele en klinische behoeften van de afdeling Medische Microbiologie en Infectiepreventie.

We realiseren dit met een end-to-end datapipeline die dagelijks data ophaalt uit het elektronisch patiëntendossier en het laboratoriuminformatiesysteem, en deze integreert met de klinische genomics-pipelines van MMI. Vervolgens passen we AI-algoritmen toe voor geautomatiseerde rapportage, door de gebruiker aangeleverde analyses op maat en snelle statistische analyses van complexe fenomenen. Voorbeelden van onze eindproducten zijn:

  • Samenvatting van de medische geschiedenis ter ondersteuning van klinische consultaties

  • AI-ondersteunde klinische beslissingsondersteuning voor empirische antibioticabehandeling
  • Realtime surveillance van nosocomiale bloedbaaninfecties
  • Syndromische surveillance van luchtweginfecties met behulp van grote taalmodellen
  • Resistentiefenotypering en fylogenetische analyses van klinische monsters, gekoppeld aan gedetailleerde patiëntgegevens voor uitbraaksurveillance
  • Realtime visualisatie van antimicrobiële resistentiepatronen

Stafleden MIT

  • Sanjat Kanjilal, Hoofd MIT
  • Jelle Koopsen, Coördinator MIT
  • Rogier Schade, arts-microbioloog
  • Matthijs Welkers, arts-microbioloog